Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SctQ08535 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SctQ08535 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SctQ08535 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SctQ08535 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SctQ08535 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SctQ08535 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SctQ08535 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SctQ08535 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SctQ08535 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SctQ08535 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SctQ08535 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SctQ08535 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SctQ08535 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SctQ08535 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SctQ08535 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SctQ08535 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SctQ08535 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SctQ08535 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SctQ08535 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SctQ08535 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SctQ08535 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SctQ08535 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SctQ08535 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SctQ08535 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SctQ08535 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SctQ08535 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SctQ08535 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SctQ08535 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SctQ08535 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SctQ08535 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SctQ08535 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SctQ08535 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SctQ08535 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SctQ08535 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SctQ08535 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SctQ08535 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SctQ08535 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SctQ08535 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SctQ08535 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SctQ08535 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SctQ08535 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SctQ08535 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SctQ08535 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SctQ08535 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SctQ08535 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SctQ08535 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SctQ08535 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SctQ08535 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SctQ08535 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SctQ08535 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SctQ08535 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SctQ08535 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms