Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ebf1Q07802 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf1Q07802 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms