Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gch1Q05915 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gch1Q05915 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gch1Q05915 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gch1Q05915 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms