Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcad1Q04692 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcad1Q04692 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcad1Q04692 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcad1Q04692 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms