Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CkbQ04447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CkbQ04447 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CkbQ04447 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CkbQ04447 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CkbQ04447 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CkbQ04447 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms