Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Runx1Q03347 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Runx1Q03347 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms