Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp11Q02853 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp11Q02853 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms