Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GscQ02591 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GscQ02591 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GscQ02591 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GscQ02591 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GscQ02591 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GscQ02591 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GscQ02591 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GscQ02591 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GscQ02591 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GscQ02591 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GscQ02591 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GscQ02591 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GscQ02591 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GscQ02591 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GscQ02591 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GscQ02591 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GscQ02591 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GscQ02591 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GscQ02591 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GscQ02591 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GscQ02591 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GscQ02591 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GscQ02591 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GscQ02591 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GscQ02591 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GscQ02591 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GscQ02591 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GscQ02591 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GscQ02591 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GscQ02591 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GscQ02591 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GscQ02591 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GscQ02591 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GscQ02591 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GscQ02591 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GscQ02591 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GscQ02591 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GscQ02591 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GscQ02591 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GscQ02591 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GscQ02591 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GscQ02591 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GscQ02591 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GscQ02591 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GscQ02591 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GscQ02591 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GscQ02591 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GscQ02591 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GscQ02591 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GscQ02591 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GscQ02591 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GscQ02591 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GscQ02591 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GscQ02591 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms