Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme2Q01768 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme2Q01768 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nme2Q01768 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nme2Q01768 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme2Q01768 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme2Q01768 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme2Q01768 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme2Q01768 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme2Q01768 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme2Q01768 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nme2Q01768 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme2Q01768 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme2Q01768 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme2Q01768 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms