Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja5Q01231 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gja5Q01231 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gja5Q01231 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gja5Q01231 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja5Q01231 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 887.4 ms