Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp4Q00724 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp4Q00724 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp4Q00724 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms