Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd80Q00609 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd80Q00609 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd80Q00609 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd80Q00609 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd80Q00609 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms