Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax8Q00288 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax8Q00288 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms