Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited1P97769 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms