Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas2P97460 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas2P97460 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npas2P97460 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas2P97460 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas2P97460 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas2P97460 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas2P97460 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas2P97460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas2P97460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npas2P97460 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas2P97460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas2P97460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms