Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Taf1bP97358 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Taf1bP97358 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Taf1bP97358 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf1bP97358 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms