Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx2-3P97334 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nkx2-3P97334 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx2-3P97334 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms