Protein–RNA interactions for Protein: P97288

Htr4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr4P97288 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr4P97288 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr4P97288 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr4P97288 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr4P97288 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr4P97288 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Htr4P97288 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr4P97288 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr4P97288 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr4P97288 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr4P97288 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr4P97288 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms