Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim43cP86449 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43cP86449 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43cP86449 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43cP86449 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43cP86449 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms