Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43bP86448 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43bP86448 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43bP86448 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms