Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ElocP83940 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ElocP83940 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ElocP83940 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ElocP83940 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ElocP83940 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ElocP83940 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ElocP83940 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ElocP83940 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ElocP83940 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ElocP83940 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ElocP83940 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ElocP83940 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ElocP83940 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ElocP83940 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ElocP83940 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ElocP83940 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ElocP83940 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ElocP83940 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ElocP83940 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ElocP83940 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ElocP83940 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ElocP83940 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ElocP83940 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ElocP83940 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ElocP83940 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ElocP83940 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ElocP83940 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ElocP83940 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ElocP83940 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ElocP83940 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ElocP83940 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ElocP83940 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ElocP83940 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ElocP83940 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ElocP83940 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ElocP83940 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ElocP83940 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ElocP83940 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ElocP83940 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ElocP83940 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ElocP83940 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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