Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErgP81270 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErgP81270 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ErgP81270 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ErgP81270 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErgP81270 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ErgP81270 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ErgP81270 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ErgP81270 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ErgP81270 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ErgP81270 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ErgP81270 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ErgP81270 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ErgP81270 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ErgP81270 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ErgP81270 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ErgP81270 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ErgP81270 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ErgP81270 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ErgP81270 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ErgP81270 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ErgP81270 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ErgP81270 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ErgP81270 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErgP81270 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErgP81270 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErgP81270 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErgP81270 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ErgP81270 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErgP81270 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErgP81270 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErgP81270 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErgP81270 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ErgP81270 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ErgP81270 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErgP81270 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErgP81270 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErgP81270 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ErgP81270 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ErgP81270 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ErgP81270 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ErgP81270 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ErgP81270 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ErgP81270 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErgP81270 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErgP81270 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErgP81270 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErgP81270 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErgP81270 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ErgP81270 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ErgP81270 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms