Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb2P81117 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb2P81117 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb2P81117 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nucb2P81117 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nucb2P81117 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms