Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx3P81067 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx3P81067 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx3P81067 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx3P81067 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx3P81067 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx3P81067 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx3P81067 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms