Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Irx2P81066 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx2P81066 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx2P81066 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irx2P81066 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx2P81066 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irx2P81066 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irx2P81066 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx2P81066 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx2P81066 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx2P81066 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx2P81066 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms