Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp8a1P70704 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp8a1P70704 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp8a1P70704 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp8a1P70704 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms