Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb6P70689 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb6P70689 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb6P70689 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb6P70689 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb6P70689 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms