Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ErfP70459 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErfP70459 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErfP70459 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErfP70459 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ErfP70459 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ErfP70459 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ErfP70459 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErfP70459 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErfP70459 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErfP70459 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErfP70459 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ErfP70459 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ErfP70459 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErfP70459 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErfP70459 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErfP70459 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErfP70459 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ErfP70459 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErfP70459 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErfP70459 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErfP70459 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErfP70459 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ErfP70459 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ErfP70459 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErfP70459 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErfP70459 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ErfP70459 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ErfP70459 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErfP70459 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErfP70459 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErfP70459 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ErfP70459 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ErfP70459 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErfP70459 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErfP70459 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErfP70459 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ErfP70459 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErfP70459 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ErfP70459 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErfP70459 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErfP70459 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErfP70459 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ErfP70459 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ErfP70459 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErfP70459 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErfP70459 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ErfP70459 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErfP70459 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ErfP70459 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ErfP70459 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms