Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irf7P70434 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irf7P70434 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Irf7P70434 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Irf7P70434 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf7P70434 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf7P70434 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf7P70434 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf7P70434 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf7P70434 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf7P70434 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf7P70434 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf7P70434 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf7P70434 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf7P70434 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf7P70434 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf7P70434 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf7P70434 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms