Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SeboxP70368 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SeboxP70368 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeboxP70368 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeboxP70368 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms