Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aup1P70295 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aup1P70295 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aup1P70295 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aup1P70295 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aup1P70295 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aup1P70295 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aup1P70295 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aup1P70295 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aup1P70295 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aup1P70295 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aup1P70295 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aup1P70295 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aup1P70295 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms