Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad54lP70270 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad54lP70270 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad54lP70270 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms