Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf5P70191 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Traf5P70191 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf5P70191 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Traf5P70191 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Traf5P70191 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf5P70191 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf5P70191 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms