Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl39P62892 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms