Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ElobP62869 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ElobP62869 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ElobP62869 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ElobP62869 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ElobP62869 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ElobP62869 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ElobP62869 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ElobP62869 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ElobP62869 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ElobP62869 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ElobP62869 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ElobP62869 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ElobP62869 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ElobP62869 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ElobP62869 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms