Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmo4P61969 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmo4P61969 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmo4P61969 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms