Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab6bP61294 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab6bP61294 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab6bP61294 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab6bP61294 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab6bP61294 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab6bP61294 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms