Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem258P61166 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem258P61166 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmem258P61166 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem258P61166 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem258P61166 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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