Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2kP61087 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2kP61087 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.2 ms