Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eif3eP60229 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Eif3eP60229 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Eif3eP60229 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Eif3eP60229 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms