Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lman2lP59481 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lman2lP59481 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lman2lP59481 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lman2lP59481 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms