Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdrg1P59048 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdrg1P59048 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms