Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strn4P58404 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strn4P58404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strn4P58404 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Strn4P58404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strn4P58404 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Strn4P58404 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn4P58404 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Strn4P58404 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Strn4P58404 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Strn4P58404 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Strn4P58404 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Strn4P58404 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Strn4P58404 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms