Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GferP56213 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GferP56213 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GferP56213 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GferP56213 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GferP56213 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GferP56213 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GferP56213 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GferP56213 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GferP56213 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GferP56213 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GferP56213 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GferP56213 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GferP56213 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GferP56213 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GferP56213 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GferP56213 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GferP56213 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GferP56213 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GferP56213 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GferP56213 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GferP56213 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GferP56213 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GferP56213 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GferP56213 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GferP56213 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GferP56213 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GferP56213 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GferP56213 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GferP56213 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GferP56213 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms