Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ephb4P54761 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ephb4P54761 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb4P54761 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb4P54761 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.8 ms