Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RabggtbP53612 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RabggtbP53612 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RabggtbP53612 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RabggtbP53612 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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