Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lbx1P52955 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lbx1P52955 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lbx1P52955 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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