Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst2P52850 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst2P52850 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst2P52850 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst2P52850 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms