Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold1P52431 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pold1P52431 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold1P52431 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pold1P52431 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold1P52431 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pold1P52431 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms