Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clcn3P51791 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn3P51791 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn3P51791 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn3P51791 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms